c:ms:multiple_regression_lecture_note_for_r
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| ====== Output ====== | ====== Output ====== | ||
| - | ===== Simple regression ===== | ||
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| - | > # multiple regression: a simple e.g. | ||
| - | > # | ||
| - | > # | ||
| - | > rm(list=ls()) | ||
| - | > d <- read.csv(" | ||
| - | > d | ||
| - | | ||
| - | 1 6 220 5 | ||
| - | 2 5 190 6 | ||
| - | 3 7 260 3 | ||
| - | 4 7 200 4 | ||
| - | 5 8 330 2 | ||
| - | 6 | ||
| - | 7 8 210 3 | ||
| - | 8 | ||
| - | 9 9 320 1 | ||
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| - | > | ||
| - | > colnames(d) <- c(" | ||
| - | > d | ||
| - | y x1 x2 | ||
| - | 1 6 220 5 | ||
| - | 2 5 190 6 | ||
| - | 3 7 260 3 | ||
| - | 4 7 200 4 | ||
| - | 5 8 330 2 | ||
| - | 6 10 490 4 | ||
| - | 7 8 210 3 | ||
| - | 8 11 380 2 | ||
| - | 9 9 320 1 | ||
| - | 10 9 270 3 | ||
| - | > # attach(d) | ||
| - | > lm.y.x1 <- lm(y ~ x1, data=d) | ||
| - | > summary(lm.y.x1) | ||
| - | |||
| - | Call: | ||
| - | lm(formula = y ~ x1, data = d) | ||
| - | |||
| - | Residuals: | ||
| - | Min 1Q Median | ||
| - | -1.5189 -0.8969 -0.1297 | ||
| - | |||
| - | Coefficients: | ||
| - | Estimate Std. Error t value Pr(> | ||
| - | (Intercept) 3.617781 | ||
| - | x1 0.015269 | ||
| - | --- | ||
| - | Signif. codes: | ||
| - | |||
| - | Residual standard error: 1.176 on 8 degrees of freedom | ||
| - | Multiple R-squared: | ||
| - | F-statistic: | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | 단순회귀분석에서 (simple regression) F-test와 t-test는 (slope test) 기본적으로 똑 같은 테스트를 말한다. 왜냐하면 F-test에 기여하는 독립변인이 오직하나이고 그 하나가 slope test에 (t-test) 사용되기 때문이다. 이것은 t-test의 t값과 F-test의 F값의 관계에서도 나타난다. | ||
| - | |||
| - | $$ t^2 = F $$ | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | > t.cal <- 3.7 | ||
| - | > t.cal^2 | ||
| - | [1] 13.69 | ||
| - | > F.cal <- 13.69 | ||
| - | > F.cal | ||
| - | [1] 13.69 | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | Simple regression에서 설명한 것처럼 기울기에 (slope) 대한 t-test는 기울기가 y 변인의 variability를 (평균을 중심으로 흔들림을) 설명하는 데 기여했는가를 테스트 하기 위한 것이다. 기울기가 0 이라면 이는 평균을 (평균선이 기울기가 0이다) 사용하는 것과 같으므로 기울기의 효과가 없음을 의미한다. 따라서 b와 b zero의 차이가 통계학적으로 의미있었는가를 t-test한다. | ||
| - | $$ \text{t calculated value} = \frac {b - 0}{se} $$ | ||
| - | 위에서 $se$는 아래처럼 구한다고 언급하였다. | ||
| - | |||
| - | \begin{eqnarray*} | ||
| - | se & = & \sqrt{\frac{1}{n-2} * \frac{\text{SSE}}{\text{SSx}}} \\ | ||
| - | & = & \sqrt{\frac {\text{MSE}} {\text{SSx}}} \\ | ||
| - | \text{note that MSE } & = & \text{mean square error } \\ | ||
| - | & = & \text{ms.res } | ||
| - | \end{eqnarray*} | ||
| - | |||
| - | 위에서 구한 t값의 p value는 R에서 | ||
| - | < | ||
| - | summary(lm.y.x1) | ||
| - | n <- length(y) | ||
| - | k <- 1 # num of predictor variables | ||
| - | sse <- sum(lm.y.x1$residuals^2) | ||
| - | ssx1 <- sum((x1-mean(x1))^2) | ||
| - | b <- lm.y.x1$coefficient[2] | ||
| - | se < | ||
| - | t.b.cal <- (b - 0) / se | ||
| - | t.b.cal | ||
| - | p.value <- 2 * pt(t.b.cal, n-k-1, lower.tail=F) | ||
| - | p.value | ||
| - | # checck | ||
| - | t.b.cal | ||
| - | f.cal <- t.b.cal^2 | ||
| - | f.cal | ||
| - | p.value | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | > summary(lm.y.x1) | ||
| - | |||
| - | Call: | ||
| - | lm(formula = y ~ x1, data = d) | ||
| - | |||
| - | Residuals: | ||
| - | Min 1Q Median | ||
| - | -1.5189 -0.8969 -0.1297 | ||
| - | |||
| - | Coefficients: | ||
| - | Estimate Std. Error t value Pr(> | ||
| - | (Intercept) 3.617781 | ||
| - | x1 0.015269 | ||
| - | --- | ||
| - | Signif. codes: | ||
| - | |||
| - | Residual standard error: 1.176 on 8 degrees of freedom | ||
| - | Multiple R-squared: | ||
| - | F-statistic: | ||
| - | |||
| - | > n <- length(y) | ||
| - | > k <- 1 # num of predictor variables | ||
| - | > sse <- sum(lm.y.x1$residuals^2) | ||
| - | > ssx1 <- sum((x1-mean(x1))^2) | ||
| - | > b <- lm.y.x1$coefficient[2] | ||
| - | > se < | ||
| - | > t.b.cal <- (b - 0) / se | ||
| - | > t.b.cal | ||
| - | x1 | ||
| - | 3.699639 | ||
| - | > p.value <- 2 * pt(t.b.cal, n-k-1, lower.tail=F) | ||
| - | > | ||
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| - | x1 | ||
| - | 3.699639 | ||
| - | > t.b.cal^2 | ||
| - | x1 | ||
| - | 13.68733 | ||
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| - | | ||
| - | 0.006045749 | ||
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| - | </ | ||
| - | |||
| - | < | ||
| - | > | ||
| - | > lm.y.x2 <- lm(y ~ x2, data=d) | ||
| - | > summary(lm.y.x2) | ||
| - | |||
| - | Call: | ||
| - | lm(formula = y ~ x2, data = d) | ||
| - | |||
| - | Residuals: | ||
| - | Min 1Q Median | ||
| - | -1.2537 -0.8881 -0.4851 | ||
| - | |||
| - | Coefficients: | ||
| - | Estimate Std. Error t value Pr(> | ||
| - | (Intercept) | ||
| - | x2 | ||
| - | --- | ||
| - | Signif. codes: | ||
| - | |||
| - | Residual standard error: 1.397 on 8 degrees of freedom | ||
| - | Multiple R-squared: | ||
| - | F-statistic: | ||
| - | > | ||
| - | > | ||
| - | </ | ||
| ===== Multiple regression ===== | ===== Multiple regression ===== | ||
| < | < | ||
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| </ | </ | ||
| + | ====== Simple regression ====== | ||
| + | < | ||
| + | > # multiple regression: a simple e.g. | ||
| + | > # | ||
| + | > # | ||
| + | > rm(list=ls()) | ||
| + | > d <- read.csv(" | ||
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| + | | ||
| + | 1 6 220 5 | ||
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| + | 4 7 200 4 | ||
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| + | 10 | ||
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| + | 1 6 220 5 | ||
| + | 2 5 190 6 | ||
| + | 3 7 260 3 | ||
| + | 4 7 200 4 | ||
| + | 5 8 330 2 | ||
| + | 6 10 490 4 | ||
| + | 7 8 210 3 | ||
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| + | |||
| + | Call: | ||
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| + | |||
| + | Residuals: | ||
| + | Min 1Q Median | ||
| + | -1.5189 -0.8969 -0.1297 | ||
| + | |||
| + | Coefficients: | ||
| + | Estimate Std. Error t value Pr(> | ||
| + | (Intercept) 3.617781 | ||
| + | x1 0.015269 | ||
| + | --- | ||
| + | Signif. codes: | ||
| + | |||
| + | Residual standard error: 1.176 on 8 degrees of freedom | ||
| + | Multiple R-squared: | ||
| + | F-statistic: | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | 단순회귀분석에서 (simple regression) F-test와 t-test는 (slope test) 기본적으로 똑 같은 테스트를 말한다. 왜냐하면 F-test에 기여하는 독립변인이 오직하나이고 그 하나가 slope test에 (t-test) 사용되기 때문이다. 이것은 t-test의 t값과 F-test의 F값의 관계에서도 나타난다. | ||
| + | |||
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| + | |||
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| + | > F.cal <- 13.69 | ||
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| + | [1] 13.69 | ||
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| + | |||
| + | Simple regression에서 설명한 것처럼 기울기에 (slope) 대한 t-test는 기울기가 y 변인의 variability를 (평균을 중심으로 흔들림을) 설명하는 데 기여했는가를 테스트 하기 위한 것이다. 기울기가 0 이라면 이는 평균을 (평균선이 기울기가 0이다) 사용하는 것과 같으므로 기울기의 효과가 없음을 의미한다. 따라서 b와 b zero의 차이가 통계학적으로 의미있었는가를 t-test한다. | ||
| + | $$ \text{t calculated value} = \frac {b - 0}{se} $$ | ||
| + | 위에서 $se$는 아래처럼 구한다고 언급하였다. | ||
| + | |||
| + | \begin{eqnarray*} | ||
| + | se & = & \sqrt{\frac{1}{n-2} * \frac{\text{SSE}}{\text{SSx}}} \\ | ||
| + | & = & \sqrt{\frac {\text{MSE}} {\text{SSx}}} \\ | ||
| + | \text{note that MSE } & = & \text{mean square error } \\ | ||
| + | & = & \text{ms.res } | ||
| + | \end{eqnarray*} | ||
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c/ms/multiple_regression_lecture_note_for_r.1727653107.txt.gz · Last modified: by hkimscil
