Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- sequential_regression [2018/11/09 08:15] – [Seq.] hkimscil
+++ sequential_regression [2019/10/18 07:28] – [r] hkimscil
@@ Line 93: / Line 93: @@
 http://imaging.mrc-cbu.cam.ac.uk/statswiki/FAQ/hier
 https://ww2.coastal.edu/kingw/statistics/R-tutorials/multregr.html
+====== r ======
+<code>
+datavar <- read.csv("http://commres.net/wiki/_media/regression01-bankaccount.csv")
+datavar
+m1 <- lm(bankaccount~income+famnum, data=datavar)
+summary(m1)
+library(ppcor)
+spcor(datavar)
+pcor(datavar)
+</code>
+<code>
+> datavar <- read.csv("http://commres.net/wiki/_media/regression01-bankaccount.csv")
+> datavar
+   bankaccount income famnum
+            6    220      5
+            5    190      6
+            7    260      3
+            7    200      4
+            8    330      2
+           10    490      4
+            8    210      3
+           11    380      2
+            9    320      1
+           9    270      3
+> m1 <- lm(bankaccount~income+famnum, data=datavar)
+> summary(m1)
+Call:
+lm(formula = bankaccount ~ income + famnum, data = datavar)
+Residuals:
+    Min      1Q  Median      3Q     Max
+-1.2173 -0.5779 -0.1515  0.6642  1.1906
+Coefficients:
+             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
+(Intercept)  6.399103   1.516539   4.220  0.00394 **
+income       0.011841   0.003561   3.325  0.01268 *
+famnum      -0.544727   0.226364  -2.406  0.04702 *
+---
+Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
+Residual standard error: 0.9301 on 7 degrees of freedom
+Multiple R-squared:  0.7981,	Adjusted R-squared:  0.7404
+F-statistic: 13.84 on 2 and 7 DF,  p-value: 0.003696
+> library(ppcor)
+> spcor(datavar)
+$estimate
+            bankaccount    income     famnum
+bankaccount   1.0000000 0.5646726 -0.4086619
+income        0.7171965 1.0000000  0.2078919
+famnum       -0.6166940 0.2470028  1.0000000
+$p.value
+            bankaccount   income    famnum
+bankaccount  0.00000000 0.113182 0.2748117
+income       0.02964029 0.000000 0.5914441
+famnum       0.07691195 0.521696 0.0000000
+$statistic
+            bankaccount    income     famnum
+bankaccount    0.000000 1.8101977 -1.1846548
+income         2.722920 0.0000000  0.5623159
+famnum        -2.072679 0.6744045  0.0000000
+$n
+[1] 10
+$gp
+[1] 1
+$method
+[1] "pearson"
+> pcor(datavar)
+$estimate
+            bankaccount    income     famnum
+bankaccount   1.0000000 0.7825112 -0.6728560
+income        0.7825112 1.0000000  0.3422911
+famnum       -0.6728560 0.3422911  1.0000000
+$p.value
+            bankaccount     income     famnum
+bankaccount  0.00000000 0.01267595 0.04702022
+income       0.01267595 0.00000000 0.36723388
+famnum       0.04702022 0.36723388 0.00000000
+$statistic
+            bankaccount    income     famnum
+bankaccount    0.000000 3.3251023 -2.4064253
+income         3.325102 0.0000000  0.9638389
+famnum        -2.406425 0.9638389  0.0000000
+$n
+[1] 10
+$gp
+[1] 1
+$method
+[1] "pearson"
+## zero-order correlation
+> cor(datavar)
+            bankaccount     income     famnum
+bankaccount   1.0000000  0.7944312 -0.6922935
+income        0.7944312  1.0000000 -0.3999614
+famnum       -0.6922935 -0.3999614  1.0000000
+>
+</code>
+semipartial (part): spcor()
+|           | bankaccount  | income    | famnum  |
+| bankaccount  | 1.0000000  | <fc #ff0000>0.5646726</fc>  | <fc #ff0000>-0.4086619</fc>  |
+| income   | 0.7171965  | 1.0000000  | 0.2078919  |
+| famnum      | -0.6166940  | 0.2470028  | 1.0000000  |
+|            | bankaccount  | income  | famnum    |
+| bankaccount  | 1.0000000  | <fc #ff0000>0.7825112</fc>  | <fc #ff0000>-0.6728560</fc>    |
+| income  | 0.7825112  | 1.0000000  | 0.3422911    |
+| famnum  | -0.6728560  | 0.3422911  | 1.0000000    |
+|  | bankaccount  | income  | famnum   |
+| bankaccount  | 1.0000000  | 0.7944312  | -0.6922935  |
+| income  | 0.7944312  | 1.0000000  | -0.3999614   |
+| famnum  | -0.6922935  | -0.3999614   | 1.0000000    |